流鼻涕、咳嗽、发烧:每天都有病人带着这些典型的呼吸道感染症状出现在诊所。但是，罪魁祸首是一种可以用抗生素攻击的细菌，还是一种更难用药物治疗的病毒呢?医生们常常不能确定。但研究人员表示，他们正在接近一个准确的测试，可以迅速作出决定，就在医生的办公室。

面对未知的感染，医生有时会要求对常见细菌进行实验室检测，比如链球菌．或者他们可能会立即尝试抗生素，仅仅基于症状的强度——但抗生素的过度使用可能导致危险耐药菌株．杜克大学传染病专家Ephraim talik说:“如果能够迅速进行区分，我们就可以确保抗生素的处方没有不当。”2016年，他和他的同事开发了一项实验室测试，将常见的呼吸道症状与病毒、细菌或非传染性来源联系起来。它之所以能起作用，是因为每种病原体都会激活一组不同的基因，改变它们的RNA或蛋白质产量，而且这种检测可以在一小份血液样本中发现这些泄露秘密的“基因表达”特征。

该团队最近与一家名为BioFire的公司合作，加快测试速度，在一个小时内得出结果。这项研究对600多名急诊室病人进行了测试在危重病医学,识别细菌感染的准确率为80%，识别病毒感染的准确率接近87%。萨里克评估的一项普通实验室测试的准确率约为69%。另一些则需要费时的培养，或者只能确认医生决定检测的特定病原体。

斯坦福大学的计算免疫学家Purvesh Khatri没有参与这项研究，他说，以快速和综合的方式检测基因对病原体的反应的技术是最近才开发出来的。通过基于pcr的方法扩增RNA，这是一个关键的分析步骤，现在可以在15到20分钟内完成。卡特里与人共同创立了公司炎性atix，该公司很快将发布自己的快速测试，“以判断是否存在感染，以及哪种[病原体]可能导致感染，并提供有关严重程度的信息。”

圣路易斯华盛顿大学儿科传染病专家Gregory Storch没有参与这项研究，他说，帮助限制呼吸道感染抗生素过度使用的工具“可能对遏制抗生素耐药性的上升产生巨大影响”。尽管来自不同人群和有特定先天条件的人可能会表现出不同的基因表达模式，斯托奇希望未来的工作将解释这些差异，以确保所有人的结果都是可靠的。