由于SARS-COV-2称为B.1.617的变异是在印度在去年年底举报的,因此它已经蔓延到几十个其他国家 - 包括美国,新加坡和英国,在某些地区已经成为占主导地位。

此后,研究人员鉴定出了三种亚型,分别是B.1.617.1(“原始的”B.1.617)、B.1.617.2和B.1.617.3,它们的基因组成略有不同。

他们现在急于调查这些变体,并解决它们在他们获得立足点的国家的轨迹。关键问题仍然是速度如何蔓延的速度,它们逃避免疫力以及它们是否引起更严重的疾病。

这项研究采用了标准流行病学的形式,通过测试鉴定了负责感染的变体以及将这些数据交叉引用这些数据的临床症状和疫苗接种状态。科学家们还可以从基因组测序数据中引入洞察力,鉴定B.1.617亚型中存在的突变并将其与早期变体中的突变进行比较,其行为更好地理解。

更可传递

“我看看个体突变,因为他们认为我们认为可能会赋予更高的传播性的个性化性质,”英国莱斯特皇家医务室的顾问病毒学家Julian Tang说。增加的传播性 - 衡量变种如何从人们传播到人类的速度 - 可以加速爆发,这可能会对疫苗护理系统和疫苗接种计划等反击措施产生更多压力。18新利官网多久了例如,B.1.617.2变体具有称为452R和478K的突变,唐建既链接以增加传播率。这两个突变都改变了病毒用于进入人细胞的穗蛋白。

研究人员还能够迅速追踪B.1.617.2的扩散,因为其基因组含有显性B.1.1.7变异缺乏的标记。The presence of this marker—known as the ‘S gene target’—can be seen in the results of some of the PCR tests used to confirm cases of COVID-19, so researchers can use positive S-target hits as a proxy to quickly map the spread of B.1.617.2, without needing to sequence samples fully. Both S-gene tests and more detailed sequencing data from UK virus samples indicate that B.1.617.2 is outcompeting the two other B.1.617 subtypes, and replacing B.1.1.7—a variant identified in southeast England in late 2020—as the most common variant driving new infections in the country.

比利时鲁汶天主教大学的生物学家Tom Wenseleers正在追踪这些数据,他说:“现在在整个英格兰,我们预计50%的感染是[B.1.617.2]变种。”一个英国测序数据分析他在线分享表明,B.1.617.2感染的数量可能会增加13%,比每天B.1.1.7感染更快。

在一个5月12日发表的报告一位英国政府咨询委员会称为科学大流行性流感集团在建模上,运营亚组表示,B.1.617.2的变得比可用数据的变速器比B.1.1.7更传播了50%的“现实可能性”。

英国剑桥大学微生物学家、英国COVID-19基因组学联盟负责人莎伦·皮科克(Sharon Peacock)说:“传播率增加50%的预测听起来完全可信。”“我认为,随着数据上升得更多,我们对此会更有信心,但你不能真的忽视正在发生的事情。”

皮科克补充说,目前,B.1.617.2的激增并没有导致英国总病例数的显著上升,这仍远低于该国1月份的最新峰值。相反,人们感染的是新变种,而不是B.1.1.7。“我们在这里看到的是血统更替,”她说。

免疫逃生

另一个问题研究人员热衷于解决,是否疫苗是否对B.1.617变体持续有效。如果这些菌株中的任何一种可以避免疫苗接种赋予的免疫保护,或通过之前暴露于病毒,它们可以引发显着的新感染波浪,并脱轨计划放宽锁定和其他限制。

从理论上讲,B.1.617.2在英国的加速传播——英国超过50%的人口至少接种了一剂COVID-19疫苗——可能表明他们有能力逃避疫苗保护。但是Wenseleers说,几乎没有证据表明疫苗逃逸导致了病例的增加。来自博尔顿的5月中旬的初步数据显示,该地区因B.1.617.2引发的COVID-19住院的大多数人没有接种疫苗。博尔顿是英格兰西北部的疫情热点地区。在18名被检测为该变异阳性的住院患者中,约有5人接受了单一剂量的疫苗,只有一人接受了两种疫苗。

Wenseleers分析的单独数据表明,与B.1.617.2 Variant在西北英格兰的感染最初被聚集在未经惯常接种的青少年中。虽然随后随后传播到三十岁和四十年代的人们,但他们五十多岁的人 - 谁更有可能患有疫苗剂量的疫苗剂量 - 经历了较低的感染率。“那是令人放心的,”他说。

基因测序数据表明,B.1.617.2的快速传播不太可能像B.1.617.1的传播那样给疫苗接种工作带来问题。Tang说,在B.1.617.2中发现的452R和478K突变都与疫苗逃逸和传播能力增加有关。但是,B.1.617.1也携带一种名为484Q的不同突变,这种突变与疫苗逃逸有更强的关联。在B.1.617.2中没有发现该突变。

令人欣慰的是,没有任何B.1.617变异亚型的突变与疾病严重程度的增加有关,Tang说。

研究人员还可以进行实验室测试以检查抗体如何中和不同的病毒变体。17年代发表的一项研究自然医学表明,这种测试是真实世界免疫保护的“高度预测”。其中一些实验室表明,疫苗对B.1.617.1亚型可能较低。与B.1.617.2类似的实验尚未公布的结果,但公共卫生英格兰发布的数据在23日可能暗示辉瑞 - Biontech和牛津 - Astrazeneca疫苗18新利官网多久了对两剂量后B.1.617.2有效

建模未来传播

一些关键的不确定性仍然存在,包括B.1.617.2比其他变种(如目前在英国和许多其他国家建立的B.1.1.7变种)的传播能力要高多少。伦敦大学学院(University College London)的卫生保健研究员克里斯蒂娜·佩格尔(Christina Pagel)说:“患病人数可能会增加50%,但也可能增加10%,或增加60-70%。”18新利官网多久了建立这一模型将使科学家能够建立更精确的模型,以了解这些变异可能对包括英国在内的国家的疫情爆发产生的影响。佩格尔说:“这将使夏天的情况发生巨大的变化。”“20%到50%之间的差别就像温和的浪潮和一月份那样的激增之间的区别。所以这确实需要确定下来。”

佩格尔还质疑疫苗有效性的结果是否令人放心。她说:“说疫苗‘有效’并不是很有帮助,因为疫苗的有效性是有范围的。”疫苗效力研究往往集中于预防严重疾病和死亡的能力。但她说,了解接种过疫苗的人是否能感染B.1.617.2变种而不生病并将其传播也很重要。如果是这样的话,“你就不会得到与其他情况相同水平的群体免疫”。

孔雀表示,继续收集来自英国爆发的流行病学数据将有助于回答这些问题。它还将有助于预测其他国家的B.1.617变异的潜在影响,特别是发展中国家,这尚未普遍获得疫苗。“我们表示,我们通过制作这些测量为世界提供服务,”她说。

本文已及其复制而成第一次出版5月24日2021年。