斑点的豚鼠散发到图利奥·德·奥利维拉(Tulio de Oliveira)坐在花园中,描述了不断增长的SARS-COV-2冠状病毒家族的两个新成员。新利棋牌手机版下载被称为BA.4和BA.5,该子变量现在在南非的流行率正在增长,病毒学家领导的地方南非斯泰伦博斯大学的流行病反应与创新中心,世界上最强大的SARS-COV-2基因组监视计划之一。

这些病毒引起了世界卫生组织(WHO)的注意,因为根据实验室研究,它们的突变可能使它们能够18新利官网多久了逃避与Omicron的现有版本相比,从COVID-19-19-19-19疫苗或以前的感染中获得的免疫力更强烈。德奥利维拉(De Oliveira)清楚地表明,他并没有对BA.4和BA.5感到惊慌。尽管在过去的一个月中,该子变量在南非迅速获得了基础,但该国的Covid-19案件和住院率稳定。他之所以没有因为他以前经历过,他的团队在大流行期间也发现了类似的发现,并且知道了演习。他说:“现在是时候谨慎而勤奋,平静地工作了。”

科学家现在正在研究迄今在九个国家中发现的这些子变量,以确定其影响是否足够严重以保证干预措施。随着它的发展,SARS-COV-2将继续变异,但并非每个变体都具有新闻价值。为了确定什么值得关注,伦敦帝国学院的病毒学家温迪·巴克莱(Wendy Barclay)说,研究人员专注于两个因素:“我们关心疾病严重程度的差异,并且我们关心一种逃避疫苗的变体,因为即使我们有同样的严重程度,案件的增加仍然对生活产生重大影响。”

同时,研究人员正在努力公开传达他们的关注以及对变体的不确定性,同时并没有引起不必要的政府政策和焦虑。去年年底,当德奥利维拉(De Oliveira)的团队发现了原始的奥米克隆(Omicron)时,包括美国和英国在内的国家援引了对南非的旅行禁令。禁令未能防止这种变体的传播,但严重破坏了已经陷入困境的南非经济。如果再次发生这种情况,De Oliveira说:“我将停止与世界实时分享数据,但会继续与我的政府分享,以指导我们自己的回应。”

新变体

On 1 April, Eduan Wilkinson, a bioinformatician on de Oliveira’s team at Stellenbosch, saw that researchers at the centre’s lab and at the National Institute for Communicable Diseases in Johannesburg had flagged several abnormal SARS-CoV-2 genome sequences in their latest batch of data. The sequences had a few notable mutations in the region of SARS-CoV-2 that encodes its spike protein. Because the spike protein is key to the virus invading cells, Wilkinson recognized an urgent need to hunt for these mutations in all of the genomes sequenced in the country over the past few months to see if they had skirted by unnoticed.

在整个周末工作,他和他的同事发现他们有。一个月前(在3月的第一周)BA.4和BA.5序列占南非大约500个基因组的5%。到4月的第一周,这一部分已上升至50%。那一周,一个国际病毒分类小组确定BA.4和BA.5确实是他们在Omicron家族树上独立的谱系,并给了他们名字。

除了来自南非的积累序列外,在过去的两周中,已将BA.4序列上传到Botswana,比利时,丹麦和英国的数据平台,BA.5出现了来自中国,法国,德国和葡萄牙。

使BA.4和BA.5脱颖而出的一件事是它们共享的氨基酸突变,称为F486V。它位于病毒的尖峰蛋白上,附近蛋白质附着在细胞上的ACE2受体上,这种相互作用可打开感染门。响应CoVID-19疫苗和先前用SARS-COV-2感染的重要抗体通过附着在该位置中中和该病毒。

自去年以来,病毒学家开始注意到实验室实验中这个位置的脆弱性。例如,纽约市西奈山医学院的病毒学家本赫尔·李(Benhur Lee)和他的同事们通过将其暴露于携带许多版本的SARS-COV-2 Spike蛋白质的人造病毒中,帮助审查有希望的单克隆抗体治疗。只有一种尖峰蛋白的一种版本逃避了抗体。它的突变与F486V几乎相同。

当时,Lee松了一口气,该突变在现实生活中消失了,这表明它以某种方式阻碍了该病毒。GISAID中近1000万SARS-COV-2序列中只有大约50个包含该突变,因此Lee感到确保抗体处理仍然广泛有用。但是,随着BA.4和BA.5在南非的迅速上升,冠状病毒似乎已经进化,因此突变不再使它恢复原状。新利棋牌手机版下载

风险分析

WHO的病毒学家Lorenzo Subissi说,该机构正在跟踪这两个亚行动。但是,在得出关于它们是否构成与其他Omicron变体相比构成额外威胁的任何结论之前,它需要从对人的流行病学研究中学习更多。免疫学家还通过暴露于先前感染了SARS-COV-2和已接种疫苗的人的人的血液来接触免疫逃脱的问题。

“这就是为什么我们立即将样品提供给世界各地的研究人员的原因,”德奥利维拉说。其中包括南非和英国的研究人员,以及美国国立卫生研究院和中国疾病控制与预防中心的研究人员。18新利官网多久了

在确定了BA.4和BA.5之后,De Oliveira还与南非政府会面,并与该国约200名研究人员组成的联盟,以制定下一步的制定措施。由于南非的住院时间没有增加,每天只有大约1200例病例,他建议政府不要为国家提供比起已经更严格的指导。到目前为止,政府还没有改变其规则。

德·奥利维拉(De Oliveira)特别谨慎,他如何将变体的新闻传达给其他国家的卫生官员,要求他们继续监视,同时又不触发很大的徒劳政策,18新利官网多久了例如旅行禁令,这可能造成的弊大于利。“我们对我们有很大的压力,”德奥利维拉说。“当我们报告Omicron时,我和我的同事受到了死亡威胁。我们必须将安全性放在实验室前。”

面对这种紧张关系,巴克莱为南非的监视工作和透明度表示赞赏。尽管今年的SARS-COV-2变体平均比以前的病毒版本不那么严重,但她说这并不是表明冠状病毒将继续变得较弱。新利棋牌手机版下载除了获得常规突变外,SARS-COV-2还可以通过重组迅速发展,将一个序列的一部分从变体中插入另一个基因组中。巴克莱说,如果Omicron变体重新组合不同的SARS-COV-2变体,则可能会产生一种病毒,既可以逃避免疫力又会使人们患病。“如果这些新变体是该病毒变得更温和的趋势的一部分,那将是很棒的,但是没有生物学理由相信这将永远是这种情况。”

这个故事得到了普利策中心的支持。

本文经许可复制,是首次出版2022年4月15日。